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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital. |
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Data corrente: |
24/01/2023 |
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Data da última atualização: |
14/03/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
CAMARGO, A. P.; SOUZA, R. S. C. de; JOSE, J.; GERHARDT, I. R.; DANTE, R. A.; MUKHERJEE, S.; HUNTEMANN, M.; KYRPIDES, N. C.; CARAZZOLLE, M. F.; ARRUDA, P. |
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Afiliação: |
ANTONIO P. CAMARGO, UNIVERSIDADE ESTADUAL DE CAMPINAS; RAFAEL S. C. DE SOUZA, UNIVERSIDADE ESTADUAL DE CAMPINAS, SYMBIOMICS MICROBIOME SOLUTIONS; JULIANA JOSE, UNIVERSIDADE ESTADUAL DE CAMPINAS; ISABEL RODRIGUES GERHARDT, CNPTIA; RICARDO AUGUSTO DANTE, CNPTIA; SUPRATIM MUKHERJEE, DEPARTMENT OF ENERGY JOINT GENOME INSTITUTE; MARCEL HUNTEMANN, DEPARTMENT OF ENERGY JOINT GENOME INSTITUTE; NIKOS C. KYRPIDES, DEPARTMENT OF ENERGY JOINT GENOME INSTITUTE; MARCELO F. CARAZZOLLE, UNIVERSIDADE ESTADUAL DE CAMPINAS; PAULO ARRUDA, UNIVERSIDADE ESTADUAL DE CAMPINAS. |
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Título: |
Plant microbiomes harbor potential to promote nutrient turnover in impoverished substrates of a Brazilian biodiversity hotspot. |
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Ano de publicação: |
2023 |
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Fonte/Imprenta: |
The ISME Journal, v. 17, n. 3, p. 354-370, Mar. 2023. |
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DOI: |
https://doi.org/10.1038/s41396-022-01345-1 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
The substrates of the Brazilian campos rupestres, a grassland ecosystem, have extremely low concentrations of phosphorus and nitrogen, imposing restrictions to plant growth. Despite that, this ecosystem harbors almost 15% of the Brazilian plant diversity, raising the question of how plants acquire nutrients in such a harsh environment. Here, we set out to uncover the taxonomic profile, the compositional and functional differences and similarities, and the nutrient turnover potential of microbial communities associated with two plant species of the campos rupestres-dominant family Velloziaceae that grow over distinct substrates (soil and rock). Using amplicon sequencing data, we show that, despite the pronounced composition differentiation, the plant-associated soil and rock communities share a core of highly efficient colonizers that tend to be highly abundant and is enriched in 21 bacterial families. Functional investigation of metagenomes and 522 metagenome-assembled genomes revealed that the microorganisms found associated to plant roots are enriched in genes involved in organic compound intake, and phosphorus and nitrogen turnover. We show that potential for phosphorus transport, mineralization, and solubilization are mostly found within bacterial families of the shared microbiome, such as Xanthobacteraceae and Bryobacteraceae. We also detected the full repertoire of nitrogen cycle-related genes and discovered a lineage of Isosphaeraceae that acquired nitrogen-fixing potential via horizontal gene transfer and might be also involved in nitrification via a metabolic handoff association with Binataceae. We highlight that plant-associated microbial populations in the campos rupestres harbor a genetic repertoire with potential to increase nutrient availability and that the microbiomes of biodiversity hotspots can reveal novel mechanisms of nutrient turnover. MenosThe substrates of the Brazilian campos rupestres, a grassland ecosystem, have extremely low concentrations of phosphorus and nitrogen, imposing restrictions to plant growth. Despite that, this ecosystem harbors almost 15% of the Brazilian plant diversity, raising the question of how plants acquire nutrients in such a harsh environment. Here, we set out to uncover the taxonomic profile, the compositional and functional differences and similarities, and the nutrient turnover potential of microbial communities associated with two plant species of the campos rupestres-dominant family Velloziaceae that grow over distinct substrates (soil and rock). Using amplicon sequencing data, we show that, despite the pronounced composition differentiation, the plant-associated soil and rock communities share a core of highly efficient colonizers that tend to be highly abundant and is enriched in 21 bacterial families. Functional investigation of metagenomes and 522 metagenome-assembled genomes revealed that the microorganisms found associated to plant roots are enriched in genes involved in organic compound intake, and phosphorus and nitrogen turnover. We show that potential for phosphorus transport, mineralization, and solubilization are mostly found within bacterial families of the shared microbiome, such as Xanthobacteraceae and Bryobacteraceae. We also detected the full repertoire of nitrogen cycle-related genes and discovered a lineage of Isosphaeraceae that acquired nitrogen-fixing pot... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Campos rupestres; Data sequencing; Ecossistema de pastagens; Microbioma vegetal; Plant microbiomes; Sequenciamento de dados; Soil microbes. |
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Thesagro: |
Bactéria; Genoma; Nitrogênio. |
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Thesaurus Nal: |
Genome; Nitrogen; Velloziaceae. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/1151181/1/AP-Plant-microbiomes-2022.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA) |
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Biblioteca |
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Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Meio Ambiente. |
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Data corrente: |
19/03/2014 |
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Data da última atualização: |
29/09/2020 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
QUEIROGA, J. L. de; JUNQUEIRA, A. da C.; AVILA, P. C.; CANUTO, J. C.; URCHEI, M. A.; MALAGODI-BRAGA, K. S. |
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Afiliação: |
JOEL LEANDRO DE QUEIROGA, CNPMA; JOAO CARLOS CANUTO, CNPMA; MARIO ARTEMIO URCHEI, CNPMA; KATIA SAMPAIO MALAGOLI BRAGA, CNPMA. |
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Título: |
Monitoramento em agroflorestas: adequação de metodologias para a avaliação da sustentabilidade. |
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Ano de publicação: |
2013 |
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Fonte/Imprenta: |
Cadernos de Agroecologia, Cruz Alta, v. 8, n. 2, 2013. Resumo 15155. Edição dos resumos do VIII Congresso Brasileiro de Agroecologia, Porto Alegre, 2013. |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
Resumo: O processo de aproximação das metodologias científicas modernas à realidade do agricultor familiar e de seus sistemas de produção perpassa pelo desafio de colocá-lo no papel de protagonista deste processo, participando da aplicação dos métodos e compreendendo os seus resultados. Neste sentido, o objetivo do presente trabalho foi desenvolver metodologias a partir da análise conjunta, combinação e adequação de procedimentos de avaliação da diversidade florística, biometria e serapilheira acumulada, em cinco lotes de agricultores do Assentamento Sepé Tiaraju. As metodologias desenvolvidas utilizam conceitos e procedimentos de fácil aplicação e compreensão por parte dos agricultores, constituindo-se em ferramentas aplicáveis ao monitoramento participativo e capazes de subsidiar o agricultor na tomada de decisão para o manejo mais eficiente dos seus SAFs. |
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Palavras-Chave: |
Indicadores ecológicos; Pesquisa participativa; Sistemas Agroflorestais. |
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Thesagro: |
Agrossilvicultura. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/216290/1/2013SP-Queiroga-Monitoramento-13069.pdf
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Marc: |
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520 $aResumo: O processo de aproximação das metodologias científicas modernas à realidade do agricultor familiar e de seus sistemas de produção perpassa pelo desafio de colocá-lo no papel de protagonista deste processo, participando da aplicação dos métodos e compreendendo os seus resultados. Neste sentido, o objetivo do presente trabalho foi desenvolver metodologias a partir da análise conjunta, combinação e adequação de procedimentos de avaliação da diversidade florística, biometria e serapilheira acumulada, em cinco lotes de agricultores do Assentamento Sepé Tiaraju. As metodologias desenvolvidas utilizam conceitos e procedimentos de fácil aplicação e compreensão por parte dos agricultores, constituindo-se em ferramentas aplicáveis ao monitoramento participativo e capazes de subsidiar o agricultor na tomada de decisão para o manejo mais eficiente dos seus SAFs.
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Registro original: |
Embrapa Meio Ambiente (CNPMA) |
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